O ano acabou para o São Carlos. A Águia foi eliminada da Copa Paulista e só volta a atuar em um torneio oficial apenas em 2014, pelo Campeonato Paulista da Série A3. Sem perder tempo, a diretoria do clube antecipou as férias de seus jogadores e marcou o dia da apresentação, que deve ocorrer no fim de outubro, para começar a ser montado o elenco que vai seguir em busca do principal objetivo do time: classificar para a Série A2.
O planejamento vem sendo feito visando o Campeonato Paulista da Série A3, mas alguns atletas mostram preocupação quando o assunto é tempo de contrato. Vários jogadores tem vínculo com o São Carlos até novembro desse ano e não sabem se vão permanecer ou sair do time.
Segundo o meia Galiardo, o São Carlos não o procurou para tratar da renovação contratual, o que deve acontecer quando voltar de férias. O jogador afirmou também que a eliminação da Copa Paulista foi decepcionante e que é a hora de levantar a cabeça e seguir em frente.
A classificação do São Carlos para a segunda fase da Copinha bateu na trave. A Águia caiu no Grupo 2, que era considerado um dos mais fortes da competição. Além de Inter de Limeira, XV de Piracicaba, Independente e Ferroviária, todos classificados, o grupo era comporto por Sertãozinho e Comercial.
O São Carlos acabou a competição na quinta colocação com 12 pontos, a cinco da Ferroviária, quarta colocada.